Auxinas:

Principal: Ácido indol-3-acético (AIA)
Biosíntesis: El AIA es sintetizado a partir de triptófano (o alguno de sus precursores inmediatos) en:

• Primordios foliares (meristemos foliares)
• Hojas jóvenes
• Semillas en desarrollo
• Meristemos apicales del tallo
• Meristemos radiculares

En general, en todas las partes de las plantas.
Hidiátodo à Centro de síntesis de la auxina
Transporte:

• Tejidos vasculares
• Transporte polar (célula a célula)

En tallos, el transporte es basípeto (del ápice a la base). En raíces, el transporte es basípeto y acrópeto (de la base al ápice). La acidez del apoplasto hace que el AIA esté fundamentalmente protonado (IAAH) y por tanto, tiene un carácter lipófilo lo que facilita su difusión a través de la MP y su entrada en la célula (citosol). También, se produce su entrada vía simpuerto H⁺/IAA, dependiente de la bomba de protones de la MP. El pH neutro o ligeramente alcalino del citosol hace que el AIA esté en su forma aniónica (IAA^–) y solo puede salir por la MP vía transportadores de eflujo (PIN), que se orienta asimétricamente en la MP para producir el transporte polar de las auxinas (unidireccional).
Ruta:
I) Auxinas y elongación celular:

1. El AIA se une al receptor (ABP1), el cual activa la proteína G y esta a la fosfolipasa A (PLA), la cual libera segundos mensajeros que activan la bomba de H⁺.
2. La salida de H⁺ acidifica la pared celular, lo que causa la activación de expansinas, que rompen los puentes de rigidez de la pared y la entrada de H₂O a la célula a favor de gradiente.
3. La entrada de agua a la célula provoca un incremento en el volumen celular.
4. El proceso finaliza con la incorporación de nuevos materiales de la pared (celulosa y polisacáridos de la matriz), que hacen que la pared gane de nuevo rigidez, asegurando así, la irreversibilidad de la expansión celular.

II) Expresión diferencial de genes activando la degradación de represores transcriptacionales. Cuando la concentración de auxina alcanza un calor umbral, la auxina se une a receptores TIR o AFBs que activan el complejo E3 Ubiquitina ligasa del que forman parte, el cual marca a los represores transcripcionales (AUX/IAA) para su degradación en el proteasoma. De este modo, los factores de transcripción ARF se pueden activar, produciéndose la transcripción de genes de respuesta primaria en auxinas.
Funciones:

1. Implicación en el establecimiento del eje apical-basal de la planta durante la embriogénesis (primeras fases). En la primera división el cigoto origina una célula apical y una basal (asimétricas). Los transportadores PIN canalizan la auxina de origen materno a la célula apical. Las células apical y basal se dividen, los transporta PIN, redistribuyen la auxina hasta las células apicales y su acumulación en el proembrión especifica la formación del MAT. Cuando el embrión globular comienza a sintetizar su propia auxina en la zona apical, los transport PIN se relocalizan provocando un transporte basípeto de auxinas especificándose al MAR.
2. Control de la iniciación de los primordios foliares y la filotaxia (modo en el que se disponen las hojas en el tallo). Los transport. PIN llevan la auxina a la zona donde saldrá el primordio foliar, los primordios foliares preexistentes acapararán todas las auxinas de alrededor por lo que no saldrá otro primordio cerca.
3. Control de la expresión de los genes (gen WOX, homólogo del gen WUS en el MAT) necesarios para el mantenimiento del CQ (células troncales estructurales) y el nicho de células troncales (células troncales funcionales), PZ.
4. Interviene en la formación de raíces laterales en el periciclo (capa más externa de células del cilindro central en capacidad organogénica), la cual es precedida por una acumulación de auxina mediatizada por los transp. PIN.
5. La auxina sintetizada en la yerma apical del tallo (MAT), interactúa negativamente con las citoquininas (CK) y positivamente sobre estrigolactonas (reprimen el rebrote de las yemas axilares), reprimiendo el rebrote de las yemas axilares y promoviendo de la dominancia apical.
6. La disminución en los niveles endógenos de auxinas tras dos semanas de polinización activa los mecanismos que desencadenan la maduración de los frutos.
7. Implicada en los tropismos. Una señal asimétrica provoca la recolocalización de los transportadores de eflujo (PIN) de auxina, que lleva a una distribución asimétrica de la auxina, provocando su acumulación en la zona y llevándose a cabo el tropismo hacia el estímulo (hipótesis de Cholodiny-Went).
8. Determina el destino celular del gametofito femenino. Hay un máximo de auxina en el polo del saco embrionario. El máximo de auxina específica las sinérgidas, seguido de la célula huevo, célula central y la menor concentración de auxina en las células antípodas.
9. Activación durante la fase morfogénesis (formación del embrión à Embriogénesis) en las semillas.
10. Las auxinas sintetizadas en las semillas promueven el crecimiento de los frutos. La fertilización del óvulo incrementa los niveles de auxina, lo que lleva (vía ruta ubiquitina-proteosoma) a la degradación de los represores y a la transcripción de genes implicados en el crecimiento del fruto.
11. El transporte polar de auxinas hacia la zona de absorción foliar durante la fase de mantenimiento de la hoja, reduce la sensibilidad de la zona al etileno, por lo que no se produce la absorción foliar.
12. A partir de un explanto; los balances auxinas/CKs favorables a auxinas promueven la formación de raíces o la formación de la embriogénesis somática (sin fecundación).

Degradación: Por oxidación irreversible de la hormona y su consecuente pérdida de actividad biológica.
Descarboxilativa: Pérdida del grupo COOH de la cadena lateral como CO₂
No descarboxilativa: